DeepSeek Harness のネイティブプラグインとして DSH を生命科学向けの Claude Science 風研究ワークベンチにする：ReAct 研究ループ、証跡付きバージョン管理アーティファクト、SSH / HPC リモート計算。
DSH 統合
ネイティブ実行
作者による申告
安全性監査
未監査
最終検証日
2026-09-05
ライセンス
MIT
01どんなタスクに使えるのか？
DeepSeek Harness 上でゲノミクス / 病原体 / 人間の健康 / バイオインフォマティクスの ReAct 研究ループを回す
`research-manifest.json` ステートマシン（問い → 仮説 → 実験 → 観察 → 分析 → 結論 → 次の問い）
DeepSeek Harness を使うバイオインフォマティクスや生命科学の研究者で、構造化され再現性のある研究ループを求める人
すべての結果を証跡付きのバージョン管理アーティファクトとして保存する
`artifacts/<name>/v<N>/` に保存され、ファイルごとの SHA-256、`artifact.json` の証跡、追記専用の `provenance.md` を含む
コマンド / 入力 / 環境を記録した、監査可能で再現性のある研究成果を必要とする研究者
DeepSeek Harness セッションから SSH / HPC クラスタへ計算を投入する
リモート実行向けの 16 個の `remote_*` ツール（remote_host_add、remote_host_probe、remote_host_notes、remote_run、remote_status、remote_logs など）
DSH の研究ループから離れずにリモートクラスタでジョブを走らせたい計算生物学者
02DeepSeek Harness への導入方法
作者は未記載
03DSH 統合と能力の範囲
DeepSeek Harness 向けのネイティブ dsh-plugin——Claude Science 風の研究ワークベンチで、ReAct 研究ループエンジン、証跡付きバージョン管理アーティファクト、SSH / HPC リモート計算エンジンを提供します。
ReAct 研究ループエンジン
ゲノミクス / 病原体 / 人間の健康 / バイオインフォマティクスの研究課題→8 個の research_* ツールが駆動する research-manifest.json ステートマシン
証跡付きバージョン管理アーティファクト
任意の研究成果→artifacts/<name>/v<N>/（ファイルごとの SHA-256、artifact.json の証跡、追記専用の provenance.md）
リモート計算エンジン（SSH / HPC クラスタ）
リモートホスト / クラスタで実行する計算ジョブ→SSH / HPC クラスタ実行向けの 16 個の remote_* ツール
ユーザーが設定した外部 SSH / HPC ホストへ接続する
04誰に向いているのか？使うべきでない場面は？
向いている用途
- DeepSeek Harness を使うバイオインフォマティクスや生命科学の研究者で、構造化され再現性のある研究ループを求める人
- コマンド / 入力 / 環境を記録した、監査可能で再現性のある研究成果を必要とする研究者
- DSH の研究ループから離れずにリモートクラスタでジョブを走らせたい計算生物学者
05互換性・メンテナンス・セキュリティ上の注意
- リモート計算エンジンは SSH / HPC クラスタを対象とするため、利用者が用意する SSH または HPC クラスタへのアクセス権が必要です。ローカル専用の機能ではありません。
- Node.js >= 18 が必要です（README の node バッジが node>=18 を示しています）。
MIT · 活発にメンテナンス中（最新リリース v0.2.0、2026-08-18）
06よくある質問
dsh-science とは何ですか。DeepSeek Harness とはどう統合されますか。
dsh-science は Claude Science 風の研究ワークベンチで、DeepSeek Harness 向けの dsh-plugin として、ゲノミクス / 病原体 / 人間の健康 / バイオインフォマティクスをカバーします。ReAct 研究ループエンジン、証跡付きバージョン管理アーティファクト、SSH / HPC リモート計算エンジン、そして 11 個のサイエンススキルを提供します。
ReAct 研究ループはどのツールで構成されますか。
8 個の research_* ツール——research_init、research_state、research_hypothesis、research_experiment、research_findings、research_phase、research_review、research_report——が research-manifest.json ステートマシン（問い → 仮説 → 実験 → 観察 → 分析 → 結論 → 次の問い）に永続化されます。
アーティファクトの証跡はどう管理されますか。
各結果は artifacts/<name>/v<N>/ に保存され、ファイルごとの SHA-256、artifact.json の証跡記録（コマンド / 入力 / 環境 / envFile）、追記専用の provenance.md を伴い、artifact_save / artifact_list / artifact_show / artifact_diff / artifact_verify / artifact_deprecate / artifact_reproduce で操作できます。
リモートクラスタで計算できますか。
はい——リモート計算エンジンは 16 個の remote_* ツール（remote_host_add、remote_host_probe、remote_host_notes、remote_run、remote_status、remote_logs など）を SSH / HPC クラスタ実行向けに提供します。利用者が用意する SSH または HPC クラスタへのアクセス権が必要です。
07関連する DSH ワークフロー
weknora
by tencent
オープンソースのLLMナレッジプラットフォーム。生ドキュメントを検索可能なRAG、自律推論エージェント、自己更新型Wikiへ変換する。
honcho
by plastic-labs
ステートフルなエージェントを構築するためのメモリライブラリ。会話履歴や状態を管理し、長期的な文脈保持を実現します。
webnovel-writer
by lingfengqaq
Claude Codeを基盤にした長編Web小説向けの執筆支援システム。AIの「忘却」や「幻覚」を抑え、200万字規模の連載制作に対応します。
mirage
by strukto-ai
AI エージェント向けの統合仮想ファイルシステム
08データと出典
for [DeepSeek Harness](https://github.com/deepseek-ai/deepseek-harness) — for genomics / pathogens / human health / bioi…
Claude Science-style research workbench for DSH: ReAct research-loop engine (research_* tools)
このページは、プロジェクトの公開ドキュメント、リポジトリのメタデータ、および DSH Plugins の構造化解析に基づいて生成されています。最終検証日：2026-09-05。誤りを見つけた場合は、修正を送信してください。
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