一个原生 DeepSeek Harness 插件，把 DSH 变成面向生命科学的 Claude Science 风格科研工作台：ReAct 研究循环、带溯源的版本化产物，以及 SSH / HPC 远程计算。
DSH 适配
原生运行时
作者声明
安全审计
未审计
最后核验
2026-09-05
许可证
MIT
01它能帮你完成什么？
在 DeepSeek Harness 里跑基因组学 / 病原体 / 人类健康 / 生物信息学的 ReAct 研究循环
一份 `research-manifest.json` 状态机，记录 问题 → 假设 → 实验 → 观察 → 分析 → 结论 → 下一个问题
使用 DeepSeek Harness 的生物信息学与生命科学研究者，想要结构化、可复现的研究循环
把每个结果存成带溯源的版本化产物
结果保存在 `artifacts/<name>/v<N>/` 下，含逐文件 SHA-256、`artifact.json` 溯源记录与只追加的 `provenance.md`
需要可审计、可复现科研成果（记录命令 / 输入 / 环境）的研究者
从 DeepSeek Harness 会话把计算任务分发到 SSH / HPC 集群
16 个 `remote_*` 工具（remote_host_add、remote_host_probe、remote_host_notes、remote_run、remote_status、remote_logs 等）用于远程执行
需要在远程集群上跑任务、又不想离开 DSH 研究循环的计算生物学家
02如何接入 DeepSeek Harness？
作者未说明
03DSH 适配与能力边界
DeepSeek Harness 的原生 dsh-plugin——一套 Claude Science 风格科研工作台，提供 ReAct 研究循环引擎、带溯源的版本化产物，以及 SSH / HPC 远程计算引擎。
ReAct 研究循环引擎
基因组学 / 病原体 / 人类健康 / 生物信息学的研究问题→八个 research_* 工具驱动的 research-manifest.json 状态机
带溯源的版本化产物
任意研究结果→artifacts/<name>/v<N>/，含逐文件 SHA-256、artifact.json 溯源与只追加的 provenance.md
远程计算引擎（SSH / HPC 集群）
要在远程主机 / 集群上跑的计算任务→16 个 remote_* 工具，用于 SSH / HPC 集群执行
连接到你配置的外部 SSH / HPC 主机
04适合谁？何时不该用？
适合
- 使用 DeepSeek Harness 的生物信息学与生命科学研究者，想要结构化、可复现的研究循环
- 需要可审计、可复现科研成果（记录命令 / 输入 / 环境）的研究者
- 需要在远程集群上跑任务、又不想离开 DSH 研究循环的计算生物学家
05兼容性、维护与安全提示
- 远程计算引擎面向 SSH / HPC 集群，需要你提供 SSH 或 HPC 集群访问权限；它不是纯本地功能。
- 需要 Node.js >= 18（README 的 node 徽章标注 node>=18）。
MIT · 活跃维护中（最新发布 v0.2.0，2026-08-18）
06常见问题
dsh-science 是什么，怎么和 DeepSeek Harness 集成？
dsh-science 是一套 Claude Science 风格的科研工作台，作为 dsh-plugin 接入 DeepSeek Harness，覆盖基因组学 / 病原体 / 人类健康 / 生物信息学。它提供 ReAct 研究循环引擎、带溯源的版本化产物、SSH / HPC 远程计算引擎，以及 11 个科学技能。
ReAct 研究循环由哪些工具组成？
八个 research_* 工具——research_init、research_state、research_hypothesis、research_experiment、research_findings、research_phase、research_review、research_report——持久化到 research-manifest.json 状态机（问题 → 假设 → 实验 → 观察 → 分析 → 结论 → 下一个问题）。
产物溯源是怎么做的？
每个结果都存为 artifacts/<name>/v<N>/，含逐文件 SHA-256、artifact.json 溯源记录（命令 / 输入 / 环境 / envFile）与只追加的 provenance.md，通过 artifact_save / artifact_list / artifact_show / artifact_diff / artifact_verify / artifact_deprecate / artifact_reproduce 操作。
能在远程集群上跑计算吗？
可以——远程计算引擎提供 16 个 remote_* 工具（remote_host_add、remote_host_probe、remote_host_notes、remote_run、remote_status、remote_logs 等）用于 SSH / HPC 集群执行。需要你提供 SSH 或 HPC 集群访问权限。
07相关的 DSH 工作流
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08数据与来源
for [DeepSeek Harness](https://github.com/deepseek-ai/deepseek-harness) — for genomics / pathogens / human health / bioi…
Claude Science-style research workbench for DSH: ReAct research-loop engine (research_* tools)
页面基于项目公开文档、仓库元数据和 DSH Plugins 的结构化解析生成；最后核验于 2026-09-05。发现错误？提交更正。
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